RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	RKM5	Q12367	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PMR1	P13586	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TRX3	P25372	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PHO91	P27514	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FUN30	P31380	1131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	KKQ8	P36004	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RRN10	P38204	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TRM5	P38793	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MET30	P39014	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LRO1	P40345	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FET5	P43561	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MPS3	P47069	682 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GTO1	P48239	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HNT2	P49775	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MIG2	P53035	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YNL140C	P53910	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NDL1	Q06568	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PHO81	P17442	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TYR1	P20049	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MRPS28	P21771	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
APJ1	YNL077W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CBP4	P37267	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	FZO1	P38297	855 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	FTH1	P38310	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	APQ12	P40532	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YJL049W	P47048	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YJR142W	P47173	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	COG2	P53271	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IRC15	Q02733	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ROY1	Q04847	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	BNA5	Q05979	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NMD4	Q12129	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	JLP1	Q12358	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	UBR1	P19812	1950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	KAR1	P11927	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CCA1	P21269	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	BUB3	P26449	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ADE1	P27616	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CWP1	P28319	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATO2	P32907	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SKN1	P33336	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATG7	P38862	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SIT1	P39980	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	VRG4	P40107	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	AYR1	P40471	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MNT3	P40549	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IAH1	P41734	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	FMP32	P43557	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	AIM22	P47051	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TNA1	P53322	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MCH5	Q08777	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	DIN7	Q12086	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATP6	P00854	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GAL7	P08431	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	AGP1	P25376	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SPS22	P25380	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ZIP1	P31111	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NUF2	P33895	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	COS111	P38308	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	HPM1	P40481	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	FHN1	P53279	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	DYN3	Q04949	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	STP3	Q05937	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NSL1	Q12143	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	LAG2	Q92325	660 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ARG81	P05085	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.7 ms