RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	FAR8	Q05040	523 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IPK1	Q06667	281 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	NDE2	Q07500	545 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SEY1	Q99287	776 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	HXT2	P23585	541 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	URK1	P27515	501 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YOX1	P34161	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SKT5	P34226	696 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CPR5	P35176	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YHR122W	P38829	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	BRE2	P43132	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RCF2	P53721	224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SPP2	Q02521	185 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	NSE1	Q07913	336 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PNS1	Q12412	539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PDE2	P06776	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MAS1	P10507	462 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	STE18	P18852	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RRT12	P25381	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	DUG2	P38149	878 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YAP3	P38749	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	BIG1	P38813	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IPI3	P53877	555 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IZH1	Q03419	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	KRE28	Q04431	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	AAD15	Q08361	143 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	UBA3	Q99344	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	ALG1	P16661	449 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RPO26	P20435	155 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RPD3	P32561	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YPK3	P38070	525 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	LNP1	P38878	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YHR210C	P38893	341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SAK1	P38990	1142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	ERG28	P40030	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	POG1	P40473	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SNG1	P46950	547 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IDS2	P46958	469 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PKP2	P53170	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	EFM6	P53970	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MMT1	Q03218	510 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	GPM2	Q12008	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	QCR7	P00128	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	QCR2	P07257	368 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CBS2	P14905	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SSO1	P32867	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SAF1	P38352	637 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MSS4	P38994	779 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	FRT2	P39734	528 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MPS1	P54199	764 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RMI1	Q02685	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	TAF12	Q03761	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	GIS1	Q03833	894 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	VPS36	Q06696	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	TPO1	Q07824	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	MRP13	P12686	339 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	RPH1	P39956	796 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	JLP2	P40206	208 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SPG5	P42933	373 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.34	□□□□□ -1.71	RIP-Chip
STB2	YMR053C	MDV1	P47025	714 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	IRC8	P47046	822 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YJR154W	P47181	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	STB4	P50104	949 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	COS12	P53053	380 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	YGR045C	P53229	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	COG2	P53271	262 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	OCA2	P53949	197 aa		4.34	□□□□□ -1.71
STB2	YMR053C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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