RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	YVC1	Q12324	675 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	COX1	P00401	534 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	CDC26	P14724	124 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	CTS1	P29029	562 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	TOA1	P32773	286 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	SSO1	P32867	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	GLG1	P36143	616 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	TSC10	P38342	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	GAB1	P41733	394 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	ATF2	P53296	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	YOL131W	Q08270	108 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	CBS2	P14905	389 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	CCA1	P21269	546 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	ARE1	P25628	610 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	USE1	P53146	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	OAZ1	Q02803	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	YMR010W	Q03687	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	SNF8	Q12483	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	ARG81	P05085	880 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	RAP1	P11938	827 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	MRPL17	P36528	281 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	TED1	P40533	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	IKS1	P47042	667 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	LCL3	P53153	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	DFG5	Q05031	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRN5	YLR141W	APN1	P22936	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	LST4	P34239	828 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	ICE2	P40499	491 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	PMT4	P46971	762 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	BDS1	Q08347	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	UNG1	P12887	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	DAP2	P18962	818 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	PMT2	P31382	759 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	VPS52	P39904	641 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YPR202W	Q08993	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	NSI1	Q12457	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	ORC2	P32833	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	STP2	P38704	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	AIM2	P39721	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	IAH1	P41734	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	RHO4	Q00246	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MDM30	Q05930	598 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	RPN6	Q12377	434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YOR019W	Q99248	730 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	ATP6	P00854	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	DGR2	P32330	852 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	DCG1	P32460	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	LYP1	P32487	611 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	SCO2	P38072	301 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	IMA5	P40884	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	GMC2	Q06201	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YEH1	Q07804	573 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YOL024W	Q08172	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	NSL1	Q12143	216 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	ROT2	P38138	954 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	COG2	P53271	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YLL007C	Q07799	665 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MCH5	Q08777	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	PTR2	P32901	601 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MSN2	P33748	704 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	GIP2	P40036	548 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	BAP3	P41815	604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	YJL043W	P47053	257 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	DIA3	P52290	468 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	CDH1	P53197	566 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MMT1	Q03218	510 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MLH3	Q12083	715 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN5	YLR141W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.53	□□□□□ -0.24	not detected
RRN5	YLR141W	ARG3	P05150	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TPK2	P06245	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	STP22	P25604	385 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	CSM1	P25651	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	NUP2	P32499	720 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SPC42	P36094	363 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	IST2	P38250	946 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	HPM1	P40481	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SUR7	P54003	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	ENT2	Q05785	613 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	AKR2	Q12013	749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TOP3	P13099	656 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YCL049C	P25577	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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