RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	VAM3	Q12241	283 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	REC107	P21651	314 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RHB1	P25378	209 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	BEM1	P29366	551 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SWI3	P32591	825 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YME2	P32843	850 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PXA2	P34230	853 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	MTC6	P38849	526 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HMS2	P47175	358 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PPM1	Q04081	328 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	MDM30	Q05930	598 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ORT1	Q12375	292 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	OPI1	P21957	404 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SLY1	P22213	666 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SNT1	P25357	1226 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	LSB5	P25369	354 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	BYE1	P36106	594 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	MRPL4	P36517	319 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HER2	Q03557	464 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RCF1	Q03713	159 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	CLN3	P13365	580 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YCR051W	P25631	222 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HIR2	P32480	875 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	KKQ8	P36004	724 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PIM1	P36775	1133 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SWD3	P38123	315 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SSU1	P41930	458 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SDT1	P53078	280 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SKO1	Q02100	647 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	KAP120	Q02932	1032 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	BET5	Q03630	159 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PET123	P17558	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	DAL2	P25335	343 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	CTR86	P25355	563 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	GEX1	P25596	615 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YBR137W	P38276	179 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ADD37	Q03233	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RSN1	Q03516	953 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ROY1	Q04847	553 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	DON1	Q05610	365 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SOR2	Q07786	357 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	HRT3	Q12347	344 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RMD5	Q12508	421 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ISN1	Q99312	450 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SPO7	P18410	259 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PAN6	P40459	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	TRP1	P00912	224 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	SCEI	P03882	235 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MNS1	P32906	549 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MMS4	P38257	691 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YML6	P51998	286 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MTM1	P53320	366 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	TAF12	Q03761	539 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	AFI1	Q99222	893 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MSG5	P38590	489 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YAL037W	P39728	267 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PHO86	P46956	311 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	AZR1	P50080	613 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	GPI15	P53961	229 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	HIF1	Q12373	385 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	HOM3	P10869	527 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	URA4	P20051	364 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	CLN1	P20437	546 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	ADK2	P26364	225 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	RRN10	P38204	145 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	PHB2	P50085	310 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YCT1	YLL055W	MHR1	Q06630	226 aa		2.74	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms