RNA–Protein interactions for RNA: YKR022C

NTR2, Transcript of Essential protein that forms a dimer with Ntr1p, yeast

Gene NTR2, Length 969 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NTR2	YKR022C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	COQ11	Q05892	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	RRT8	Q08219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	VAM3	Q12241	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CKA2	P19454	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	HNM1	P19807	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PET18	P25362	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ICS2	P38284	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GAA1	P39012	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CIN4	P39110	191 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PTR3	P43606	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	AFT2	Q08957	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PDE2	P06776	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ELO2	P25358	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	HIR2	P32480	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	OCT1	P35999	772 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ERG7	P38604	731 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CTM1	P38818	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YFR018C	P43599	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	AIM33	Q04516	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	FUS2	Q05670	677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	THI7	Q05998	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SFG1	Q12507	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SRN2	Q99176	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	VPS63	O13549	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	STE3	P06783	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CAB3	P36076	571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PXL1	P36166	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	TSC10	P38342	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MSG5	P38590	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	NDT80	P38830	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YFR020W	P43600	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	NMD5	P46970	1048 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	COG2	P53271	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YML053C	Q04978	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	COQ9	Q05779	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CUR1	Q06469	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ARV1	Q06541	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	TEN1	Q07921	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ULA1	Q12059	462 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	RHO2	P06781	192 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	STE4	P18851	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PHO13	P19881	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YMC1	P32331	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GDA1	P32621	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	VAB2	P40003	282 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	OPT1	P40897	799 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ATG27	P46989	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	AIM22	P47051	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YGL108C	P53139	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	LIF1	P53150	421 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MSC1	Q03104	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MCP2	Q06567	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ARP6	Q12509	438 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PUT2	P07275	575 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PET111	P08468	800 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PMR1	P13586	950 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MDM10	P18409	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GEX1	P25596	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	GAC1	P28006	793 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PSO2	P30620	661 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	MRP4	P32902	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	YET1	P35723	206 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	SIP3	P38717	1229 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PIH1	P38768	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NTR2	YKR022C	PEX18	P38855	283 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.3 ms