RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	YLR415C	O13578	112 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPS4	P09937	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MAS1	P10507	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PRR1	P28708	518 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YSC83	P32792	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GMH1	P36125	273 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DUG2	P38149	878 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YHL012W	P38709	493 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PFS1	P38872	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	OPT1	P40897	799 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DIP5	P53388	608 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPC98	P53540	846 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YNL181W	P53878	407 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SLG1	P54867	378 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MSC1	Q03104	513 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RIM13	Q03792	727 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AIM33	Q04516	312 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ATG17	Q06410	417 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YFT2	Q06676	274 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FRE5	Q08908	694 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CBF1	P17106	351 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CMK2	P22517	447 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FPS1	P23900	669 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	STE14	P32584	239 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SKT5	P34226	696 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	POP7	P38291	140 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ECM1	P39715	212 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PIG2	P40187	538 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AGE2	P40529	298 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YGL108C	P53139	140 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NSE1	Q07913	336 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RMD5	Q12508	421 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PDE1	P22434	369 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	APL1	P27351	700 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	KRE2	P27809	442 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MSS51	P32335	436 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPO23	P33757	523 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	QDR3	P38227	689 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RTC2	P38279	296 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YBR259W	P38338	688 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ELO1	P39540	310 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FAR3	P46671	204 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	VPS60	Q03390	229 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	IZH1	Q03419	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RIP1	P08067	215 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SPE1	P08432	466 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PCT1	P13259	424 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YSR3	P23501	404 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	CDC20	P26309	610 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	MEI4	P29467	408 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ECM25	P32525	599 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ASH1	P34233	588 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	RFC5	P38251	354 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	UBA4	P38820	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	FHL1	P39521	936 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YER130C	P39959	443 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	DSE1	P40077	573 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	NDC80	P40460	691 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YIL001W	P40560	513 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SNZ3	P43545	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YDL186W	P48568	277 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YGR127W	P53275	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SNZ2	P53824	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	ORC3	P54790	616 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	PLB2	Q03674	706 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	SSY1	Q03770	852 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKS1	YJL057C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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