RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	NDL1	Q06568	189 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	PGC1	Q08959	321 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ORT1	Q12375	292 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ALG1	P16661	449 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	DAP2	P18962	818 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.93	□□□□□ -1.94	not detected
VMA10	YHR039C-A	NDI1	P32340	513 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ANP1	P32629	500 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	PFF1	P38244	976 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YSW1	P38280	609 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.93	□□□□□ -1.94	not detected
VMA10	YHR039C-A	RRT5	P43607	289 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RTT101	P47050	842 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	AVT4	P50944	713 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	GPI15	P53961	229 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	GIP3	Q03016	1276 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	PPM1	Q04081	328 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	URH1	Q04179	340 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	DAP1	Q12091	152 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RUP1	Q12242	671 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	CYB2	P00175	591 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YML002W	P0CF17	737 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	MSP1	P28737	362 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	DAD2	P36162	133 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	GPI16	P38875	610 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ALG8	P40351	577 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YJL070C	P40361	888 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RPR2	P40571	144 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	HMS2	P47175	358 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YNR048W	P53740	393 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	FRE4	P53746	719 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	TOF1	P53840	1238 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	MEH1	Q02205	184 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	AYT1	Q12226	474 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RMD5	Q12508	421 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	PDE2	P06776	526 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ATR1	P13090	542 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	LSB5	P25369	354 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ITR1	P30605	584 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	PMU1	P36069	295 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	MRPL4	P36517	319 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	SIF2	P38262	535 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	COS10	P52924	374 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	BTN2	P53286	410 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	NSE1	Q07913	336 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	REX4	Q08237	289 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	SGT1	Q08446	395 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YLL056C	Q12177	298 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ATG34	Q12292	412 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VMA10	YHR039C-A	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	HEM2	P05373	342 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	CHS1	P08004	1131 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	IMA3	P0CW40	589 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	IMA4	P0CW41	589 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RAD57	P25301	460 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	STP2	P38704	541 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	WSS1	P38838	269 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RPH1	P39956	796 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	CHS6	P40955	746 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	EPL1	P43572	832 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	PIB2	P53191	635 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	POP6	P53218	158 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	MRP51	Q02950	344 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	YDR541C	Q03049	344 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	PIR3	Q03180	325 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	RSN1	Q03516	953 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VMA10	YHR039C-A	YFH1	Q07540	174 aa		2.9	□□□□□ -1.95

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