RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W EMC2P47133 292 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W GTR2P53290 341 aa8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W MET31Q03081 177 aa8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W GET4Q12125 312 aa8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W SRV2P17555 526 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W DAP2P18962 818 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W ERG8P24521 451 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W ARE1P25628 610 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W IDH2P28241 369 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W MNN2P38069 597 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W APE4P38821 490 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W GIP2P40036 548 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W SMX2P40204 77 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W PKP1P40530 394 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W UBP6P43593 499 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W UPF3P48412 387 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W RCF2P53721 224 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W MSC1Q03104 513 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W USA1Q03714 838 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W VHS3Q08438 674 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YLR053CQ12026 108 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W APC9Q12107 265 aa8.35□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W PBS2P08018 668 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W COS2P0CX12 379 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W COS3P0CX13 379 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W PTR2P32901 601 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W MSN2P33748 704 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W SPO23P33757 523 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W SET3P36124 751 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W CIN1P40987 1014 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W COS4P43542 379 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W APS3P47064 194 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YJR154WP47181 346 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W ALG12P53730 551 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YPR172WQ06608 200 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YOR223WQ12015 292 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W YOS9Q99220 542 aa8.34□□□□□ -1.07
CPD1YGR247W CBS2P14905 389 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W HSC82P15108 705 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W GPI12P23797 304 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data8.33□□□□□ -1.08not detected
CPD1YGR247W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data8.33□□□□□ -1.08not detected
CPD1YGR247W TRR2P38816 342 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YIL067CP40514 678 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W TED1P40533 473 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W PSA1P41940 361 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W AIM22P47051 409 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YJL043WP47053 257 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SLM2P53955 656 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YLR352WQ06479 807 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YPR091CQ06833 770 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YOR365CQ08844 703 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RCN2Q12044 265 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W NTO1Q12311 748 aa8.33□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RHO2P06781 192 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W DST1P07273 309 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W PET111P08468 800 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W VPS51P36116 164 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RIM2P38127 377 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W ATG7P38862 630 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W ARI1P53111 347 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W PFA5Q03289 374 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W HER1Q12276 1246 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YVC1Q12324 675 aa8.32□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W OCA4P25366 362 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W NFU1P32860 256 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W FES1P38260 290 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W TOK1P40310 691 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MEP2P41948 499 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W URB2P47108 1174 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YGR079WP53249 370 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YLR460CP54007 376 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W IRC15Q02733 499 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YPL071CQ02864 156 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YLR446WQ06204 433 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W YDL121CQ07541 149 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MDM12Q92328 271 aa8.31□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SYP1P25623 870 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W ERG9P29704 444 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data8.3□□□□□ -1.08not detected
CPD1YGR247W ARB1P40024 610 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MET18P40469 1032 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W XBP1P40489 647 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W SHR5P41912 237 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W FMP32P43557 207 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W RPE1P46969 238 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W MUP1P50276 574 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W ATP25Q03153 612 aa8.3□□□□□ -1.08
CPD1YGR247W VPS60Q03390 229 aa8.3□□□□□ -1.08
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