RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	AIM41	Q12032	185 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SPS100	P13130	326 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SPS22	P25380	463 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YIM1	P28625	365 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RRN3	P36070	627 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MUP3	P38734	546 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	IRC6	P43615	237 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	STE24	P47154	453 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MUP1	P50276	574 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	TEL2	P53038	688 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CRN1	Q06440	651 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	UBX3	Q12229	455 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RAD1	P06777	1100 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	APN1	P22936	367 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	TRX3	P25372	127 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PTC6	P25646	442 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PTM1	P32857	523 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	IFA38	P38286	347 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PIC2	P40035	300 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	XBP1	P40489	647 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CAB2	P40506	365 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.37	□□□□□ -1.55	not detected
SYF2	YGR129W	MDV1	P47025	714 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YGR067C	P53243	804 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	TNA1	P53322	534 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GAS3	Q03655	524 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	TAF12	Q03761	539 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RAD34	Q06665	692 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YLR358C	O13565	187 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YML002W	P0CF17	737 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	VPS33	P20795	691 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	ERG8	P24521	451 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	ERG9	P29704	444 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CBP4	P37267	147 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MAL32	P38158	584 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YBR071W	P38243	211 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
SYF2	YGR129W	YJL043W	P47053	257 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	REC102	Q02721	264 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	NHP10	Q03435	203 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	APC4	Q04601	652 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	REX4	Q08237	289 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MLH3	Q12083	715 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CKI1	P20485	582 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CTS1	P29029	562 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RKM3	P38222	552 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	FAD1	P38913	306 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MKC7	P53379	596 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CRR1	Q05790	422 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GAS2	Q06135	555 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PDR8	Q06149	701 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RSA1	Q08932	381 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RUP1	Q12242	671 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	YPR064W	Q12492	139 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	DAP2	P18962	818 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	AAD3	P25612	363 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	NUP120	P35729	1037 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	HES1	P35843	434 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	BAP2	P38084	609 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PKP1	P40530	394 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PRM10	P42946	383 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SAE2	P46946	345 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SDT1	P53078	280 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	BUD32	P53323	261 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	FAR10	Q06001	478 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
SYF2	YGR129W	FLO9	P39712	1322 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	GCR1	P07261	785 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	GPA2	P10823	449 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	STE12	P13574	688 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	CBF1	P17106	351 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56

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