RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W GPI11Q06636 219 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W REX4Q08237 289 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GET4Q12125 312 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W STE6P12866 1290 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W CMK2P22517 447 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W BUB3P26449 341 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W BUD14P27637 709 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W CDC13P32797 924 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SKN1P33336 771 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MUM2P38236 366 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data8.46□□□□□ -1.06not detected
DDI1YER143W MNN9P39107 395 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MAD2P40958 196 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W AGP3P43548 558 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RMR1P53060 241 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SDT1P53078 280 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ARE2P53629 642 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YKU80Q04437 629 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PDR8Q06149 701 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YOR342CQ12182 319 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YOL107WQ12239 342 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W NTO1Q12311 748 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YPR064WQ12492 139 aa8.46□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RAD7P06779 565 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W GAL7P08431 366 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W AGP1P25376 633 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DOM34P33309 386 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RIB1P38066 345 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SLM4P38247 162 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RCK1P38622 512 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W BEM4P39011 633 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DLD3P39976 496 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SNL1P40548 159 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MRK1P50873 501 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RTS3P53289 263 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YNR068CP53754 272 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DSL1P53847 754 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YPL071CQ02864 156 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YML096WQ04489 525 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ARR1Q06596 294 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PUN1Q06991 263 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PSY3Q12318 242 aa8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SNF4P12904 322 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W GAL3P13045 520 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DMC1P25453 334 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PEX3P28795 441 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W CTS1P29029 562 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ERG1P32476 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ASC1P38011 319 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MNN2P38069 597 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YEL020CP39994 560 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YPS6P40583 537 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data8.44□□□□□ -1.06not detected
DDI1YER143W RAD17P48581 401 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MSC1Q03104 513 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PEX12Q04370 399 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DIN7Q12086 430 aa8.44□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YCL049CP25577 312 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ARP2P32381 391 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SFA1P32771 386 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SWH1P35845 1188 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W UTH1P36135 365 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W APT2P36973 181 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W BNA4P38169 460 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YHR112CP38716 378 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W LAS21P40367 830 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ROG1P53118 685 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W XYL2Q07993 356 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W THP1Q08231 455 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PUS9Q12069 462 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MHF2Q3E829 80 aa8.43□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SUI3P09064 285 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W NUP2P32499 720 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SCO2P38072 301 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SWD1P39706 426 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RBG1P39729 369 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RIC1P40395 1056 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W QDR2P40474 542 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W COS7Q07788 383 aa8.42□□□□□ -1.06
DDI1YER143W STE7P06784 515 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SSO1P32867 290 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MDJ1P35191 511 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YHL012WP38709 493 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W LTP1P40347 161 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms