RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	NSG1	P38837	291 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MIT1	P40002	666 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HXT8	P40886	569 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MPS3	P47069	682 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
XRS2	YDR369C	ALG12	P53730	551 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TPP1	Q03796	238 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YET2	Q04210	160 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TFC6	Q06339	672 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HOS1	Q12214	470 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	GPM3	Q12326	303 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HIS5	P07172	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MAS2	P11914	482 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	URA6	P15700	204 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	KAR4	P25583	335 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MRPL9	P31334	269 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TCA17	P32613	152 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	BET3	P36149	193 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	VPS45	P38932	577 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ATM1	P40416	690 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MND2	P40577	368 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HXT14	P42833	540 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	CLD1	P53264	445 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TNA1	P53322	534 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TIM44	Q01852	431 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SND1	Q04007	877 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	CAC2	Q04199	468 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YLR224W	Q05947	369 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	EST2	Q06163	884 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TRE2	Q08693	809 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	OXR1	Q08952	273 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HFI1	Q12060	488 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SPC3	Q12133	184 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SFM1	Q12314	213 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TRM10	Q12400	293 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	AGC1	Q12482	902 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.51	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HMX1	P32339	317 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	DAL1	P32375	460 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ATP11	P32453	318 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
XRS2	YDR369C	YSC84	P32793	468 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YBR241C	P38142	488 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ECM8	P38246	354 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SHG1	P38337	142 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	IKI1	P38874	309 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
XRS2	YDR369C	ACO2	P39533	789 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YEN1	P40028	759 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TMA108	P40462	946 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YGR201C	P42936	225 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SNG1	P46950	547 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LOH1	P47055	219 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MOG1	P47123	218 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	BIO3	P50277	480 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MRH4	P53166	561 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MRPL22	P53881	309 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ASR1	Q06834	288 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YOP1	Q12402	180 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MIP1	P15801	1254 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	IMG1	P25626	169 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LAC1	P28496	418 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	BEM1	P29366	551 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SRB6	P32570	121 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YBL086C	P38177	466 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PGD1	P40356	397 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YIL024C	P40543	189 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SNN1	P48232	102 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ASK10	P48361	1146 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SHY1	P53266	389 aa		3.5	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85

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