RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FUS2	Q05670	677 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BUD7	Q08754	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GET4	Q12125	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ARG3	P05150	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SEC63	P14906	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GAC1	P28006	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VPS45	P38932	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YDR089W	P38966	869 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YEL057C	P39983	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MET28	P40573	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FAR3	P46671	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YML6	P51998	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MIG2	P53035	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VID30	P53076	958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ORM1	P53224	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BCP1	Q06338	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SRO77	P38163	1010 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	HXT9	P40885	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GSC2	P40989	1895 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SHE4	P51534	789 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YGR066C	P53242	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ARK1	P53974	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YET2	Q04210	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ASA1	Q06822	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YET3	Q07451	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VIK1	Q12045	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PRD1	YCL057W	GYP6	P32806	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YBR144C	P34215	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YKR015C	P36111	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ETR1	P38071	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FES1	P38260	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PRD1	YCL057W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PRD1	YCL057W	MRM2	P53123	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PMS1	P14242	873 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	CKA1	P15790	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	KDX1	P36005	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ANS1	P38832	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	CHS6	P40955	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YGR127W	P53275	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	LSB1	P53281	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SCM3	Q12334	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	REG2	P38232	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	APE4	P38821	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PEX18	P38855	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	FMP32	P43557	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MSC1	Q03104	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ARP10	Q04549	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	GRC3	Q07845	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	TEN1	Q07921	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ATX2	Q12067	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RIF1	P29539	1916 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PUT2	P07275	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	ATR1	P13090	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	MRX3	P38172	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PCA1	P38360	1216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	UBA4	P38820	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	PES4	P39684	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	LAM5	P43560	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRD1	YCL057W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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