RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	CKA2	P19454	339 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MRP20	P32387	263 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MAM33	P40513	266 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ALF1	P53904	254 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	INP2	Q03824	705 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	TFC6	Q06339	672 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.19	□□□□□ -2.38	not detected
YBL053W	YBL053W	RTP1	Q12751	981 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	RAV1	P47104	1357 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YIH1	P25637	258 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	TKL2	P33315	681 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MSR1	P38714	643 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ECM34	P38728	170 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YIL059C	P40520	121 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	HAC1	P41546	238 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	AIM22	P47051	409 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MFB1	Q04922	465 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	RIM20	Q12033	661 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	COR1	P07256	457 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	PRE8	P23639	250 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	FRM2	P37261	193 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.17	□□□□□ -2.38	not detected
YBL053W	YBL053W	AFG3	P39925	761 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	VID30	P53076	958 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	FRE4	P53746	719 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	BCH1	Q05029	724 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MRX8	Q05473	314 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	FRE8	Q12209	686 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ELO2	P25358	347 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	UBP11	P36026	717 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MUM2	P38236	366 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	COX14	P39103	70 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	PET130	P47065	347 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YGL088W	P53151	121 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	DSL1	P53847	754 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	COQ9	Q05779	260 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	SMC5	Q08204	1093 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	NYV1	Q12255	253 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YBL053W	YBL053W	MSM1	P22438	575 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	PTP2	P29461	750 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	FHL1	P39521	936 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	EGT2	P42835	1041 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	FIN1	Q03898	291 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	LOT6	Q07923	191 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	DDC1	Q08949	612 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	LDB17	Q12342	491 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	YKR032W	P36127	104 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	ALG5	P40350	334 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	SFH5	P47008	294 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	AIM24	P47127	394 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	AZR1	P50080	613 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MAL33	P38157	468 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	VHS2	P40463	436 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MET14	Q02196	202 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	VPS38	Q05919	439 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	BLS1	Q06071	122 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	DBF20	P32328	564 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	GRX4	P32642	244 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	SBE22	P38814	852 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	AXL2	P38928	823 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	RBG1	P39729	369 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MRM2	P53123	320 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	BET5	Q03630	159 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MIX17	Q03667	156 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	RHO2	P06781	192 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MIG1	P27705	504 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	TFB1	P32776	642 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	HSP31	Q04432	237 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	MDM36	Q06820	579 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	REX4	Q08237	289 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	AUS1	Q08409	1394 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YBL053W	YBL053W	GAL1	P04385	528 aa		0.1	□□□□□ -2.39

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