RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMPD4Q14CM0 1322 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TREHO43280 583 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE4AP27815 886 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G5P39877 138 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PTH1RQ03431 593 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF1Q13077 416 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TROAPQ12815 778 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3FQ13275 785 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO22Q8NEZ5 403 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 RNPEPQ9H4A4 650 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SIP14410 1827 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC22Q5TAA0 569 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH2A1L162 156 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NOP56O00567 594 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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CAPNS1-211ENST00000590874 ICAM3P32942 547 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WTAPQ15007 396 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GNPTABQ3T906 1256 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR20Q99678 358 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CD320Q9NPF0 282 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.65■■■□□ 2.34
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CAPNS1-211ENST00000590874 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM50Q86XT4 487 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 E7EWF7 191 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD9Q14511 834 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT8Q92599 483 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM122AQ96E09 287 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 USP26Q9BXU7 913 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD4Q9NVD3 440 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CAND2O75155 1236 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 STAM2O75886 525 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA7Q8NI08 942 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FIBPO43427 364 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNA5P22460 613 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMLP26374 656 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ANTXR2P58335 489 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 LEXMQ3ZCV2 418 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 EPC2Q52LR7 807 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP1MTQ969P6 601 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf16Q9NQ32 467 aa29.62■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM17P78536 824 aa29.6■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 GNAT1P11488 350 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SP4Q02446 784 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L6PQ6QN14 398 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD11Q96NU1 681 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL10Q9BUA6 226 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM86C2PA6NEL3 165 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 IL9P15248 144 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP4P98171 946 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNX4Q63HM2 1172 aa29.58■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.58■■■□□ 2.33
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CAPNS1-211ENST00000590874 PTPROQ16827 1216 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM26DQ5JW98 314 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM192Q8IY95 271 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 APBB2Q92870 758 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 LY9Q9HBG7 655 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3CDO00329 1044 aa29.55■■■□□ 2.32
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