RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SLCO1A2P46721 670 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A5Q01650 507 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO41Q8TF61 875 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PBRM1Q86U86 1689 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 GPC4O75487 556 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 LTKP29376 864 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY2CP25092 1073 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SIK1P57059 783 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ABCB6Q9NP58 842 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CPP00450 1065 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 LLGL1Q15334 1064 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 AIFM3Q96NN9 605 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM206Q9H813 350 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRM-211ENST00000580170 DYNLT1P63172 113 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SDCCAG3Q96C92 435 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 NACC1Q96RE7 527 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 DCLK2Q8N568 766 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 APOL6Q9BWW8 343 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SPC25Q9HBM1 224 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD2Q13200 908 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MB21D1Q8N884 522 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SPDL1Q96EA4 605 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS8Q9BT25 410 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ATG3Q9NT62 314 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TBK1Q9UHD2 729 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ATP7BP35670 1465 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PHEXP78562 749 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CASP8Q14790 479 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 NECTIN1Q15223 517 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ALS2CLQ60I27 953 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP7Q8WX94 980 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ACTN1P12814 892 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ATP1A3P13637 1013 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL29Q96CT2 875 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRM-211ENST00000580170 MCF2LO15068 1137 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TTC4O95801 387 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA9P43362 315 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CYP27A1Q02318 531 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ERFEQ4G0M1 354 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 GDAP1Q8TB36 358 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH3Q86UC2 560 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 BAG5Q9UL15 447 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1CO00159 1063 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G4BP0C869 781 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SLMAPQ14BN4 828 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 KRT31Q15323 416 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 NDST4Q9H3R1 872 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.283e-7■■■□□ 14.9
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PTPRM-211ENST00000580170 SEPT2Q15019 361 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2SQ16763 222 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 DR1Q01658 176 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TERF2Q15554 542 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FAM81BQ96LP2 452 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TSC22D3Q99576 134 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 LPXNO60711 386 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MFAP3LO75121 409 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 NR1D1P20393 614 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8OA6NCC3 632 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8NF8WBI6 632 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA6P17066 643 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CASP2P42575 452 aa23.06■■□□□ 1.28
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