RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL9P15248 144 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOMER1Q86YM7 354 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEPT8Q92599 483 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 SAMD11Q96NU1 681 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 YME1L1Q96TA2 773 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 POLR2MP0CAP2 368 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAF1Q13077 416 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPC2Q52LR7 807 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TREHO43280 583 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 UPP2O95045 317 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 LGALS2P05162 132 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTSHP09668 335 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEC23AQ15436 765 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAND2O75155 1236 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOXC8P31273 242 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPM6BQ13491 265 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNPTABQ3T906 1256 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 BANK1Q8NDB2 785 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOP1MTQ969P6 601 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 PIGSQ96S52 555 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRR33A8MZF0 331 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 H3BNC9 293 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNAT1P11488 350 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM192Q8IY95 271 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEK9Q8TD19 979 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP26Q9BXU7 913 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCAS3Q9H6U6 928 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALADP13716 330 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRDNQ13061 729 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEDD9Q14511 834 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRM4Q14833 912 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 SETD4Q9NVD3 440 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAM2O75886 525 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCEAL5Q5H9L2 206 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 METTL7BQ6UX53 244 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYFIP1Q7L576 1253 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 APBB2Q92870 758 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM50BQ9Y247 325 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL4A6Q14031 1691 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERICH2A1L162 156 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ICAM3P32942 547 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 UIMC1Q96RL1 719 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPR20Q99678 358 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 FIBPO43427 364 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGAP4P98171 946 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM50Q86XT4 487 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYTH3O43739 400 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTNNB1P35222 781 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 SP4Q02446 784 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 FIBCD1Q8N539 461 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL17RAQ96F46 866 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL25Q9H293 177 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLDND1Q9NY35 253 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCXO43602 365 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEMA3FQ13275 785 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM26DQ5JW98 314 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 NCK2O43639 380 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms