RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 RNPEPQ9H4A4 650 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SIP14410 1827 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 CYTH3O43739 400 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 WTAPQ15007 396 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SEPT8Q92599 483 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 SENP2Q9HC62 589 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 UPP2O95045 317 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 CYP21A2P08686 494 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 CTSHP09668 335 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 NEDD9Q14511 834 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 CYFIP1Q7L576 1253 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 USP26Q9BXU7 913 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.64■□□□□ 0.74
CS-214ENST00000548849 STAM2O75886 525 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GNAT1P11488 350 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 KCNA5P22460 613 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 HOXC8P31273 242 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 ICAM3P32942 547 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TROAPQ12815 778 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 METTL7BQ6UX53 244 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 YME1L1Q96TA2 773 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SETD4Q9NVD3 440 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 PTH1RQ03431 593 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 PTPROQ16827 1216 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 EPC2Q52LR7 807 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 NCOA7Q8NI08 942 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TOP1MTQ969P6 601 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GPR20Q99678 358 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 CD320Q9NPF0 282 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 E7EWF7 191 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 FIBPO43427 364 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 CAND2O75155 1236 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SEMA3FQ13275 785 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TTC22Q5TAA0 569 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.62■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 BRWD1Q9NSI6 2320 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 PDE4AP27815 886 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 ARHGAP4P98171 946 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SP4Q02446 784 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GPM6BQ13491 265 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TRIM50Q86XT4 487 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 CUL5Q93034 780 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 PI4K2BG5E9Z4 385 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 GPR37L1O60883 481 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 IL9P15248 144 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.6■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 H3BNC9 293 aa19.59■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 NLRX1Q86UT6 975 aa19.59■□□□□ 0.73
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CS-214ENST00000548849 APBB2Q92870 758 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-214ENST00000548849 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 FAM26DQ5JW98 314 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 EP400NLQ6ZTU2 488 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-214ENST00000548849 SENP7Q9BQF6 1050 aa19.58■□□□□ 0.72
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