RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CASC1	Q6TDU7	716 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MYL10	Q9BUA6	226 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	USP26	Q9BXU7	913 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	LY9	Q9HBG7	655 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	EMSY	Q7Z589	1322 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	FIBP	O43427	364 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	LPXN	O60711	386 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	DDAH1	O94760	285 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCA1	P28370	1054 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	KIF5B	P33176	963 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SEMA3F	Q13275	785 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	METTL7B	Q6UX53	244 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	CUL5	Q93034	780 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	COG5	Q9UP83	839 aa		18.52	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TREH	O43280	583 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PRC1	O43663	620 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HOXC8	P31273	242 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	KCNQ1	P51787	676 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GPR20	Q99678	358 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MTA3	Q9BTC8	594 aa		18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MEIS2	O14770	477 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	ERVK-21	P61565	698 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TMTC2	Q8N394	836 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TRANK1	O15050	2925 aa		18.5	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	REV3L	O60673	3130 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01553	A4QN01	128 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC69	A6NI79	296 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PIK3CD	O00329	1044 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	AMH	P03971	560 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GNAT1	P11488	350 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MCM5	P33992	734 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GNAQ	P50148	359 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	NLRX1	Q86UT6	975 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-C	Q95604	372 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM87B	Q96K49	555 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SETD4	Q9NVD3	440 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	INSL6	Q9Y581	213 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		18.49	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SP4	Q02446	784 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM50	Q86XT4	487 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SI	P14410	1827 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SLC27A2	O14975	620 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CAND2	O75155	1236 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CTSH	P09668	335 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	RXRA	P19793	462 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SEPT8	Q92599	483 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	KAT6A	Q92794	2004 aa		18.47	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CALM1	P0DP23	149 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CALM2	P0DP24	149 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CALM3	P0DP25	149 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	COL9A1	P20849	921 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	LIFR	P42702	1097 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGAP4	P98171	946 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	MUC3A	Q02505	3323 aa		18.46	■□□□□ 0.55
DDX11-222	ENST00000542777	NCOR1	O75376	2440 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ADAM17	P78536	824 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		18.45	■□□□□ 0.54

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