RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MROH6A6NGR9 719 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOBOXO60393 691 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MSCO60682 206 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SOD2P04179 222 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNR2P34972 360 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADAM9Q13443 819 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RTP5Q14D33 572 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VASNQ6EMK4 673 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LGI4Q8N135 537 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDIP1Q9H305 208 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C9orf118A6NHY6 69 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 K7ESM1 405 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC27A2O14975 620 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF28P17035 718 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLP2Q04941 152 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PAK1Q13153 545 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NTRK3Q16288 839 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SOGA3Q5TF21 947 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNT2Q6UVM3 1135 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPATC1Q76KD6 591 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTPRN2Q92932 1015 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 JAM3Q9BX67 310 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DLL4Q9NR61 685 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADCY3O60266 1144 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRG1P02750 347 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GABREP78334 506 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TUSC3Q13454 348 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RASA3Q14644 834 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SURF1Q15526 300 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF827Q17R98 1081 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPATS1Q496A3 300 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRR31Q5SQ13 230 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MCTP2Q6DN12 878 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCTD1Q719H9 257 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STK32CQ86UX6 486 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FERMT3Q86UX7 667 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNJ15Q99712 375 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CROTQ9UKG9 612 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DSEQ9UL01 958 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BLACEA4D250 179 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GSTA4O15217 222 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FBXO21O94952 628 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLATP00750 562 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CHGBP05060 677 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADRB1P08588 477 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAHP16930 419 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ST5P78524 1137 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRIN1Q05586 938 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EFEMP1Q12805 493 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SERINC3Q13530 473 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FIGNQ5HY92 759 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SYT3Q9BQG1 590 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IPPKQ9H8X2 491 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARVCFO00192 962 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WNT9AO14904 365 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAMTOR5O43504 91 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms