RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 HLA-DOAP06340 250 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MCM3P25205 808 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 VAV2P52735 878 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 LRRC41Q15345 812 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TDP2O95551 362 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 DDR1Q08345 913 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 EHHADHQ08426 723 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC181Q5TID7 509 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CREG2Q8IUH2 290 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MTMR8Q96EF0 704 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCT5P48643 541 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MS4A14Q96JA4 679 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC17Q96LX7 622 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TSG101Q99816 390 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.98■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SNX12Q9UMY4 172 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ZBTB5O15062 677 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 EDIL3O43854 480 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KIF11P52732 1056 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 HYIQ5T013 277 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 NDST4Q9H3R1 872 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MYH10P35580 1976 aa21.97■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TACC1O75410 805 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TNNI2P48788 182 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RASSF7Q02833 373 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KCTD16Q68DU8 428 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.96■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ESYT3A0FGR9 886 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 LRRC53A6NM62 1247 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 PPFIA4O75335 1185 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SHMT1P34896 483 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ARID5AQ03989 594 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 GJA10Q969M2 543 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 USP40Q9NVE5 1235 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 POTEMA6NI47 508 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 DDX12PQ92771 950 aa21.95■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 APBA1Q02410 837 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 RPS6KA5O75582 802 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 MAGEA9P43362 315 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 PTPROQ16827 1216 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TRIM58Q8NG06 486 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SAMM50Q9Y512 469 aa21.94■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 LCA5LO95447 670 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 MCTP2Q6DN12 878 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 IQCEQ6IPM2 695 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 CERS5Q8N5B7 392 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TEKT1Q969V4 418 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SGSM3Q96HU1 749 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SH2D4AQ9H788 454 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 MAGEA1P43355 309 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 IFT81Q8WYA0 676 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 MYH4Q9Y623 1939 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ATP1A2P50993 1020 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ARL8AQ96BM9 186 aa21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms