RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.89■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 TRAF5O00463 557 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 PPFIA4O75335 1185 aa24.89■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.89■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.87■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC18A3Q16572 532 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 GBP6Q6ZN66 633 aa24.85■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 TMC4Q7Z404 712 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 GANQ9H2C0 597 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 GDF3Q9NR23 364 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 EHD2Q9NZN4 543 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L10C9JJH3 530 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD1-201ENST00000331462 E9PMD0 336 aa24.83■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 MARCH6O60337 910 aa24.83■■□□□ 1.57
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HOXD1-201ENST00000331462 ERCC3P19447 782 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 GTF2IP78347 998 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 NGLY1Q96IV0 654 aa24.82■■□□□ 1.56
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HOXD1-201ENST00000331462 ATP8B3O60423 1300 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 CES2O00748 559 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 PALMO75781 387 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 GYS1P13807 737 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 IFT20Q8IY31 132 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD1-201ENST00000331462 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.82■■□□□ 1.56
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