RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328886.4

TMIGD1-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD1, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1-201ENST00000328886 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 GNAT1P11488 350 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 GHRHRQ02643 423 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 AAMPQ13685 434 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 GJD3Q8N144 294 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.53□□□□□ -0.24
TMIGD1-201ENST00000328886 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 TREHO43280 583 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CAND2O75155 1236 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 IL9P15248 144 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SP2Q02086 613 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GPM6BQ13491 265 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 HIC1Q14526 733 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 EPC2Q52LR7 807 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 FAM178BQ8IXR5 827 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SMC5Q8IY18 1101 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 MTMR8Q96EF0 704 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PIGSQ96S52 555 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 FAM50BQ9Y247 325 aa13.52□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NEDD9Q14511 834 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GRM4Q14833 912 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SEC23AQ15436 765 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 BANK1Q8NDB2 785 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 APBB2Q92870 758 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 UIMC1Q96RL1 719 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 USP26Q9BXU7 913 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CD320Q9NPF0 282 aa13.51□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 H3BQ06 376 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 STAM2O75886 525 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 ALADP13716 330 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SP4Q02446 784 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NUCB1Q02818 461 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 METTL7BQ6UX53 244 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 TMEM192Q8IY95 271 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CUL5Q93034 780 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 C11orf16Q9NQ32 467 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SETD4Q9NVD3 440 aa13.5□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PRR33A8MZF0 331 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 H3BNC9 293 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 FIBPO43427 364 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CTNNB1P35222 781 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 ARHGAP4P98171 946 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 WTAPQ15007 396 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 TRIM50Q86XT4 487 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 TOP1MTQ969P6 601 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RIOX1Q9H6W3 641 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 HOXC8P31273 242 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 ICAM3P32942 547 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NLRX1Q86UT6 975 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 FIBCD1Q8N539 461 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 IL17RAQ96F46 866 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 GPR20Q99678 358 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 CLDND1Q9NY35 253 aa13.48□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RSPH3Q86UC2 560 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 NEK9Q8TD19 979 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 LMBR1Q8WVP7 490 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIGD1-201ENST00000328886 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms