RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 TGFB3P10600 412 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 TRDNQ13061 729 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 GRM4Q14833 912 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 CD320Q9NPF0 282 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 UPP2O95045 317 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 KCNA5P22460 613 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.46■□□□□ 0.87
CABP1-201ENST00000288616 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.45■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 CYTH3O43739 400 aa20.45■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.45■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.45■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.45■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 ERICH2A1L162 156 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SP4Q02446 784 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TRAF1Q13077 416 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GNPTABQ3T906 1256 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SEPT8Q92599 483 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 YME1L1Q96TA2 773 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SETD4Q9NVD3 440 aa20.44■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 CYP21A2P08686 494 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PTH1RQ03431 593 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 WTAPQ15007 396 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 EPC2Q52LR7 807 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TRIM50Q86XT4 487 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 MYO7AQ13402 2215 aa20.43■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SEMA3FQ13275 785 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 NEDD9Q14511 834 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 USP26Q9BXU7 913 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 KAT6AQ92794 2004 aa20.42■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 IL9P15248 144 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 HOXC8P31273 242 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 METTL7BQ6UX53 244 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TOP1MTQ969P6 601 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GPR20Q99678 358 aa20.41■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GNAT1P11488 350 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PDE4AP27815 886 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 ICAM3P32942 547 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 ARHGAP4P98171 946 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TROAPQ12815 778 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 GPM6BQ13491 265 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PTPROQ16827 1216 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 TTC22Q5TAA0 569 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 NCOA7Q8NI08 942 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.4■□□□□ 0.86
CABP1-201ENST00000288616 E7EWF7 191 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 FIBPO43427 364 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 TMEM192Q8IY95 271 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 GJD3Q8N144 294 aa20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 GPR37L1O60883 481 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 STAM2O75886 525 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 CUL5Q93034 780 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 SAMD11Q96NU1 681 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 MYL10Q9BUA6 226 aa20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 H3BNC9 293 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 CAND2O75155 1236 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 CHMLP26374 656 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 BANK1Q8NDB2 785 aa20.37■□□□□ 0.85
CABP1-201ENST00000288616 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms