RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YHL026CP38740 315 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MXR1P40029 184 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W KTR7P40504 517 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W IRC18P47056 224 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W IGO1P53897 168 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YDR132CQ03900 495 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W OPT2Q06593 877 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W LCB4Q12246 624 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ATP4P05626 244 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HIS3P06633 220 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W LEU1P07264 779 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W CSE2P33308 149 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W LRG1P35688 1017 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W GLG1P36143 616 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YHR033WP38690 423 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YER137CP40083 148 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W GTS1P40956 396 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W COG1P53079 417 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W CWC25P53854 179 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.95□□□□□ -0.82not detected
PRP4YPR178W ESC8Q08119 714 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YNG1Q08465 219 aa9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W UNG1P12887 359 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SIR1P21691 654 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TOD6P34219 525 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W DRE2P36152 348 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PIM1P36775 1133 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MLH1P38920 769 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HAM1P47119 197 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SCW11P53189 542 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W DID2P69771 204 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YDR514CQ04408 483 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ARO10Q06408 635 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RRT8Q08219 342 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ATP16Q12165 160 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W LDB19Q12502 818 aa9.94□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W BIO2P32451 375 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HIS7P33734 552 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ARA1P38115 344 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W BMT2P38278 337 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W EMP65P40085 556 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W BUR6P40096 142 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ECL1P48235 211 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TPN1P53099 579 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W VAC7P53950 1165 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RAD34Q06665 692 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YPL199CQ08954 240 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HAL9Q12180 1030 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YOR214CQ12282 236 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TSC13Q99190 310 aa9.93□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HAP2P06774 265 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SAM35P14693 329 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PEX34P25584 144 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W GLY1P37303 387 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W UBA4P38820 440 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PHM8P40025 321 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PAN6P40459 309 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TES1P41903 349 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PMT4P46971 762 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W GNP1P48813 663 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MPS1P54199 764 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SDH1Q00711 640 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W VPS36Q06696 566 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RTN2Q12443 393 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SUS1Q6WNK7 96 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YCL012CQ8J0M4 134 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YOR019WQ99248 730 aa9.92□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SIR3P06701 978 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W NCP1P16603 691 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RBK1P25332 333 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RMA1P36001 430 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YBR056WP38081 501 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W ATG14P38270 344 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YHR202WP38887 602 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RRG9P40156 214 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MDV1P47025 714 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W HXT16P47185 567 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MKC7P53379 596 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MET31Q03081 177 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W JIP4Q03361 876 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MDM32Q12171 622 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SIA1Q12212 622 aa9.91□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W URA3P03962 267 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SCH9P11792 824 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W TFS1P14306 219 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RDS2P19541 446 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MIH1P23748 554 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SEC17P32602 292 aa9.9□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W VMA8P32610 256 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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