RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	MMT1	Q03218	510 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RIF2	Q06208	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GGA1	Q06336	557 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
TRM10	YOL093W	SGT1	Q08446	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	VPS68	Q12016	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	HUA2	Q12134	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	STT4	P37297	1900 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COX3	P00420	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TPK2	P06245	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CDC21	P06785	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CSM1	P25651	190 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GLG1	P36143	616 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YRO2	P38079	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TIM17	P39515	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NDE1	P40215	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GCD10	P41814	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YJR154W	P47181	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GTO1	P48239	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	EXG2	P52911	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NBP35	P52920	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MIG2	P53035	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	IMA1	P53051	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MDM34	P53083	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	USE1	P53146	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COG2	P53271	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YNL140C	P53910	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATG10	Q07879	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PLB3	Q08108	686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ENB1	Q08299	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ESA1	Q08649	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GUP2	Q08929	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TRM8	Q12009	286 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	INH1	P01097	85 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATP4	P05626	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	DGR2	P32330	852 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	HES1	P35843	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CAF4	P36130	643 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YBL029W	P38201	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	BMT2	P38278	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YBR184W	P38299	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	INM1	P38710	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	IAH1	P41734	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PFA3	P42836	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MPS3	P47069	682 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YJR030C	P47101	745 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NAS6	P50086	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MPS2	P53159	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NPY1	P53164	384 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YGR015C	P53208	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	IRC15	Q02733	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ECM11	Q04110	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TRM12	Q04235	462 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	HFD1	Q04458	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NPC2	Q12408	173 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	STE3	P06783	470 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	REC107	P21651	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SPS22	P25380	463 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PHO91	P27514	894 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SRX1	P36077	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TSC10	P38342	320 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TRM5	P38793	499 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	JEM1	P40358	645 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MET18	P40469	1032 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CAB2	P40506	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TOM22	P49334	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COS12	P53053	380 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ERP6	P53198	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	VHS1	Q03785	461 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	DYN3	Q04949	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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