RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	SHE10	P53075	577 aa		3.02	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RRD2	Q12461	358 aa		3.02	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YIM1	P28625	365 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ECM25	P32525	599 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	STB6	P36085	766 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ARA1	P38115	344 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RIB5	P38145	238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MIX23	P38162	196 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YHR054C	P38780	354 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MST28	P39552	234 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YGR210C	P42942	411 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	NCA3	P46955	337 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	FMS1	P50264	508 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	BTN2	P53286	410 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TOF1	P53840	1238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MDM1	Q01846	1127 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	VPS72	Q03388	795 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TAF11	Q04226	346 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TIM18	Q08749	192 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ERV2	Q12284	196 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	CLC1	P17891	233 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	LDB16	P25587	256 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YEL045C	P32616	141 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YLR287C	Q05881	355 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SIL1	Q08199	421 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RIP1	P08067	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SAS3	P34218	831 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	JNM1	P36224	373 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MRPL4	P36517	319 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MDG1	P53885	366 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	REX4	Q08237	289 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RAD61	Q99359	647 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	REC107	P21651	314 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ERG3	P32353	365 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	MTC6	P38849	526 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
BRX1	YOL077C	PRM5	P40476	318 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	FRE4	P53746	719 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SGT1	Q08446	395 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	HSP42	Q12329	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SFI1	Q12369	946 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SLY1	P22213	666 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	REE1	P40893	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	HMS2	P47175	358 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SRB7	P47822	140 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	SDT1	P53078	280 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YMR181C	Q03231	154 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	ADD37	Q03233	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	HER2	Q03557	464 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PPM1	Q04081	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	TMS1	Q12116	473 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BRX1	YOL077C	PET123	P17558	318 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	DAL2	P25335	343 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	RML2	P32611	393 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	FAA2	P39518	744 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	SAS2	P40963	338 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	YGL138C	P53122	345 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	YNR048W	P53740	393 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	SCM3	Q12334	223 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	SPO7	P18410	259 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	RHB1	P25378	209 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	BEM1	P29366	551 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	SIN4	P32259	974 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	KKQ8	P36004	724 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	PIM1	P36775	1133 aa		2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
BRX1	YOL077C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94

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