RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W SIS1P25294 352 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W XBP1P40489 647 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W PRK1P40494 810 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MRX6P48564 524 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YPL039WQ03080 316 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YKU80Q04437 629 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MHR1Q06630 226 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YOR022CQ12204 715 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YCL012CQ8J0M4 134 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W GCN4P03069 281 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W DSF1P0CX08 502 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YNR073CP0CX09 502 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SPC29P33419 253 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W ALY1P36117 915 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RRN10P38204 145 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SHO1P40073 367 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YJR115WP47152 169 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W HST2P53686 357 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YNL144CP53907 740 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W PNP1Q05788 311 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W GPN3Q06543 272 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W CAN1P04817 590 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RAD1P06777 1100 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MET3P08536 511 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MRP13P12686 339 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W OCA4P25366 362 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MTW1P39731 289 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TAH11P47112 604 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W VOA1P53262 265 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MET14Q02196 202 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MIX14Q04341 121 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W LPP1Q04396 274 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W PSR1Q07800 427 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YPL162CQ12042 273 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W IES3Q12345 250 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YGR035W-AQ45U48 73 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W FOB1O13329 566 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W ESS1P22696 170 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MBR1P23493 339 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SED4P25365 1065 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YBL010CP32788 280 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W LOT5P34234 306 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YBR225WP38321 900 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SWC5P38326 303 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RFC3P38629 340 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W QDR2P40474 542 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W BMT5P40493 336 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W LYS12P40495 371 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W FMP32P43557 207 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W MNT2P53059 558 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YNL011CP53980 444 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SUL2Q12325 893 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W EMP46Q12396 444 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W AGP1P25376 633 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SPT10P35208 640 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W LRG1P35688 1017 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W ASK1P35734 292 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W RTC2P38279 296 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YHR218WP38899 603 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YEN1P40028 759 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W CFD1P40558 293 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W CUZ1P53899 274 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YML131WQ03102 365 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W SNX41Q04053 625 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YDR514CQ04408 483 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W YPT6Q99260 215 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W Q0144Q9ZZW2 109 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W TPK3P05986 398 aa2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W TPK1P06244 397 aa2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W ART10P18634 518 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W NAM9P27929 486 aa2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W YOR062CP36025 268 aa2.54□□□□□ -2
YML039WYML039W YBR053CP38235 358 aa2.54□□□□□ -2
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