RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MRP13	P12686	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TOP3	P13099	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CLN2	P20438	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MEF1	P25039	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CIN8	P27895	1000 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATP11	P32453	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SOL2	P37262	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YBR071W	P38243	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TAE1	P38340	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YEL073C	P39974	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	AYR1	P40471	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HPM1	P40481	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YGL176C	P46945	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BIR1	P47134	954 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPT20	P50875	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	AQR1	P53943	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATP25	Q03153	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPC2	Q04969	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	OPI10	Q08202	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MHT1	Q12525	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CCA1	P21269	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ROT2	P38138	954 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FMO1	P38866	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	AXL2	P38928	823 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NDE1	P40215	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MPH1	P40562	993 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PFA3	P42836	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FMP33	P46998	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YJR030C	P47101	745 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NBP35	P52920	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GET1	P53192	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MPS1	P54199	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ECM9	Q02202	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ASA1	Q06822	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PLB3	Q08108	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TRM8	Q12009	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ATG29	Q12092	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RUP1	Q12242	671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	JLP1	Q12358	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SRN2	Q99176	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MDM35	O60200	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MSS18	P08593	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	BUD14	P27637	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	HXT4	P32467	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DOM34	P33309	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MRPL17	P36528	281 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	HXT7	P39004	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YIL001W	P40560	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YFL054C	P43549	646 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PTR3	P43606	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	AIM22	P47051	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	COQ5	P49017	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NPY1	P53164	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GMC2	Q06201	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
RRP3	YHR065C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TAF3	Q12297	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RGT2	Q12300	763 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DST1	P07273	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YAK1	P14680	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FUN30	P31380	1131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MRPL37	P36532	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	INM1	P38710	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TAT2	P38967	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DSS1	P39112	969 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YJL070C	P40361	888 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GAB1	P41733	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MEP2	P41948	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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