RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W YJR115WP47152 169 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W UPF3P48412 387 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W BIO3P50277 480 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GPI1P53306 609 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-DR2Q03483 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YMR010WQ03687 405 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GMC2Q06201 188 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YFT2Q06676 274 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-BQ12260 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-OR2Q12293 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RPN6Q12377 434 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-DR1Q12392 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-OR1Q12439 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SNF8Q12483 233 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YLR111WQ12528 110 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-DR3Q99303 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W THP2O13539 261 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W DAP2P18962 818 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SYP1P25623 870 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RRN10P38204 145 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data8.51□□□□□ -1.05not detected
DDI1YER143W HXT16P47185 567 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YGR016WP53209 190 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W HXT15P54854 567 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ROY1Q04847 553 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YPR022CQ12139 1133 aa8.51□□□□□ -1.05
DDI1YER143W FUR1P18562 216 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RNQ1P25367 405 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MET30P39014 640 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W FAA2P39518 744 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MTW1P39731 289 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MNT3P40549 630 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PSA1P41940 361 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CIS3P47001 227 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W KEL2P50090 882 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YOR114WQ12219 294 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W NSI1Q12457 570 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W Q0010Q9ZZX9 128 aa8.5□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W BCY1P07278 416 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ALG7P07286 448 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W UNG1P12887 359 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TYR1P20049 452 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ADE1P27616 306 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W IDH2P28241 369 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CAT2P32796 670 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W UGP1P32861 499 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GLG1P36143 616 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YBR241CP38142 488 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ELO1P39540 310 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W LRO1P40345 661 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YIL001WP40560 513 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PRM10P42946 383 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PMT4P46971 762 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SWF1Q04629 336 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ULA1Q12059 462 aa8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RED1P14291 827 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W VPS21P36017 210 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YHR033WP38690 423 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YJL043WP47053 257 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W FHN1P53279 174 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SUN4P53616 420 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ASI2P53895 289 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MFG1Q07684 458 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YLL007CQ07799 665 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W THI73Q07904 523 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RUP1Q12242 671 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TAF3Q12297 353 aa8.48□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ATP4P05626 244 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W LAT1P12695 482 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CMP2P14747 604 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W URA4P20051 364 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CDC5P32562 705 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PET127P32606 800 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data8.47□□□□□ -1.05not detected
DDI1YER143W SFC1P33303 322 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W FMP46P36141 133 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ARA1P38115 344 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W STP2P38704 541 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W CEM1P39525 442 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RSP5P39940 809 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W VHR1P40522 640 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YJL049WP47048 450 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W GOR1P53839 350 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W IGO1P53897 168 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YNL095CP53932 642 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SPR6Q01684 191 aa8.47□□□□□ -1.05
DDI1YER143W UGO1Q03327 502 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms