RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	ERG7	P38604	731 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PTC7	P38797	343 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	LNP1	P38878	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PIG2	P40187	538 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ATM1	P40416	690 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FMC1	P40491	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PDR11	P40550	1411 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IZH3	Q07959	543 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	HMI1	Q12039	706 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FMP16	Q12497	93 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PCA1	P38360	1216 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YHR210C	P38893	341 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	NPA3	P47122	385 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	STD1	Q02794	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SSY1	Q03770	852 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	COQ9	Q05779	260 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	LAM4	P38800	1345 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PCT1	P13259	424 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MGR1	P25573	417 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FMO1	P38866	432 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	POS5	Q06892	414 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CYK3	Q07533	885 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	NRT1	Q08485	598 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GAL10	P04397	699 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MSF1	P08425	469 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CDC20	P26309	610 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CNE1	P27825	502 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PSO2	P30620	661 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ACP1	P32463	125 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPR1	P32603	445 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CYM1	P32898	989 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SKN7	P38889	622 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CHA4	P43634	648 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ROG1	P53118	685 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YGL108C	P53139	140 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YGR117C	P53270	476 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ESBP6	P53918	673 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GEP3	Q08622	556 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.77	not detected
SYF1	YDR416W	YOS9	Q99220	542 aa		4.03	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	COX3	P00420	269 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AAC1	P04710	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ERG11	P10614	530 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	KRE2	P27809	442 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YER130C	P39959	443 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ECM10	P39987	644 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	OPT1	P40897	799 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PTR3	P43606	678 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BNA6	P43619	295 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ATG27	P46989	271 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GAS5	Q08193	484 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RDR1	Q08904	546 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HIS5	P07172	385 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RIP1	P08067	215 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YUR1	P26725	428 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SIP1	P32578	815 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TRM2	P33753	639 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ICS2	P38284	255 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YIR042C	P40586	236 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MPS3	P47069	682 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MSC1	Q03104	513 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ITR1	P30605	584 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	DUG2	P38149	878 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	STN1	P38960	494 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PHM8	P40025	321 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TOS3	P43637	560 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LOH1	P47055	219 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SLG1	P54867	378 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MUK1	Q02866	612 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PLB2	Q03674	706 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TGS1	Q12052	315 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PUS9	Q12069	462 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77

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