RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	YUH1	P35127	236 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AVT5	P38176	459 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	FMP23	P38231	175 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	LYS9	P38999	446 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YGL204C	P53089	101 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YNR061C	P53747	219 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CBK1	P53894	756 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SCS7	Q03529	384 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TFC6	Q06339	672 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PEX15	Q08215	383 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YNG1	Q08465	219 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CSM4	Q08955	156 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RIM20	Q12033	661 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPR1	Q12458	312 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SRN2	Q99176	213 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	VPS33	P20795	691 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ATP11	P32453	318 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TOD6	P34219	525 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	LOT5	P34234	306 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SPC34	P36131	295 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TSC10	P38342	320 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MMS21	P38632	267 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	STB5	P38699	743 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	COS8	P38723	381 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NVJ1	P38881	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SEO1	P39709	593 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YNL320W	P42840	284 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AVT1	P47082	602 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SPT20	P50875	604 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	IMO32	P53219	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
DOA4	YDR069C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YNL181W	P53878	407 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RSN1	Q03516	953 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	URH1	Q04179	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RXT3	Q07458	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	FYV7	Q12247	151 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RPN6	Q12377	434 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RPN13	O13563	156 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TPK2	P06245	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	HEM15	P16622	393 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AAC3	P18238	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SRM1	P21827	482 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
DOA4	YDR069C	DPH2	P32461	534 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TRM2	P33753	639 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	OAR1	P35731	278 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	EMC3	P36039	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MRPL15	P36523	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YBR139W	P38109	508 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	FIG1	P38224	298 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SPC97	P38863	823 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PHM8	P40025	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	VFA1	P40080	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	BST1	P43571	1029 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	GAT1	P43574	510 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PUS2	P53167	370 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MTQ1	P53944	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SKY1	Q03656	742 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	FMP45	Q07651	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	TPO1	Q07824	586 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ALE1	Q08548	619 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	THI21	Q08975	551 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ENV7	Q12003	364 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	ULA1	Q12059	462 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PHO5	P00635	467 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CDC42	P19073	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	YCK1	P23291	538 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	FUN26	P31381	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	HMX1	P32339	317 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	PDR3	P33200	976 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	MCD4	P36051	919 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	RRN10	P38204	145 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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