RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PDE4AP27815 886 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TFF2Q03403 129 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TRDNQ13061 729 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PTK7Q13308 1070 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PGM5Q15124 567 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 RIOX1Q9H6W3 641 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 GRM4Q14833 912 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 AAK1Q2M2I8 961 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 KRT40Q6A162 431 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 IL31RAQ8NI17 732 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA33Q96N06 139 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRSQ13332 1948 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 CYP21A2P08686 494 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TGFB3P10600 412 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB103AP81534 67 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF1Q13077 416 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TCTN1Q2MV58 587 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TTC22Q5TAA0 569 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SPRED2Q7Z698 418 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 HOMER1Q86YM7 354 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 WNT8BQ93098 351 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PIGSQ96S52 555 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.91■■■□□ 2.22
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PTPRF-216ENST00000617451 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 GGPS1O95749 300 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2MP0CAP2 368 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SP2Q02086 613 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
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PTPRF-216ENST00000617451 SORBS3O60504 671 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 CCND2P30279 289 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 PTH1RQ03431 593 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 GRB10Q13322 594 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 HIC1Q14526 733 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 SENP2Q9HC62 589 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 LPXNO60711 386 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TROAPQ12815 778 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 MBTPS1Q14703 1052 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRF-216ENST00000617451 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 CHMLP26374 656 aa28.87■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.87■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 E7EWF7 191 aa28.86■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 H3BRB1 525 aa28.84■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 EMSYQ7Z589 1322 aa28.84■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 THPOP40225 353 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-21P61565 698 aa28.83■■■□□ 2.21
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PTPRF-216ENST00000617451 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 STAM2O75886 525 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 LGALS2P05162 132 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 RSPH10BP0C881 870 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.82■■■□□ 2.2
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