RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616429.1

U85056.1-201, humanhuman

BASIC

Gene U85056.1, Length 682 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U85056.1-201ENST00000616429 RETREG2Q8NC44 543 aa28.24■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 NEK1Q96PY6 1258 aa28.24■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.24■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 CDC45O75419 566 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 FOSL2P15408 326 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MFSD10Q14728 455 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 RNF20Q5VTR2 975 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.23■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 ZBBXA8MT70 800 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 PPFIA4O75335 1185 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 PFKMP08237 780 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 RABGGTBP53611 331 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SEMA3FQ13275 785 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 BFSP2Q13515 415 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SCN5AQ14524 2016 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MICU3Q86XE3 530 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 C7orf31Q8N865 590 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.22■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 PIK3CDO00329 1044 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 RFC2P35250 354 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 CUL5Q93034 780 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MSRAQ9UJ68 235 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.21■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 CDH23Q9H251 3354 aa28.2■■■□□ 2.11
U85056.1-201ENST00000616429 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 ICAM3P32942 547 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 HIC1Q14526 733 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 RAB30Q15771 203 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.2■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 DLL1O00548 723 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 STAM2O75886 525 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 GPNMBQ14956 572 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 GNPTABQ3T906 1256 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 APOA5Q6Q788 366 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.19■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 MYOGP15173 224 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CAGE1Q8TC20 777 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 WNT8BQ93098 351 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.18■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 UBE2SQ16763 222 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.17■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 FIBPO43427 364 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CKBP12277 381 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 ACTN1P12814 892 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 SELPP16109 830 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 EYSQ5T1H1 3165 aa28.16■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 GBF1Q92538 1859 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 LGALS2P05162 132 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 RBL2Q08999 1139 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PTK7Q13308 1070 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 NEDD9Q14511 834 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.15■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 H3BRB1 525 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 CPA1P15085 419 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 FUT2Q10981 343 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 METTL7BQ6UX53 244 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 GPR20Q99678 358 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.14■■■□□ 2.1
U85056.1-201ENST00000616429 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
U85056.1-201ENST00000616429 KRT32Q14532 448 aa28.13■■■□□ 2.09
U85056.1-201ENST00000616429 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.13■■■□□ 2.09
U85056.1-201ENST00000616429 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.13■■■□□ 2.09
U85056.1-201ENST00000616429 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
U85056.1-201ENST00000616429 ZBTB43O43298 467 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms