RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	PDE6C	P51160	858 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	KAZALD1	Q96I82	304 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.27	□□□□□ -1.24
ACACA-231	ENST00000614428	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SRGN	P10124	158 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CORO7	P57737	925 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GUCY2D	Q02846	1103 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	COL18A1	P39060	1754 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SLC1A4	P43007	532 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SNX16	P57768	344 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SBK1	Q52WX2	424 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TFAP4	Q01664	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	H2AFV	Q71UI9	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	EPSTI1	Q96J88	318 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PANK4	Q9NVE7	773 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CHUK	O15111	745 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CTNNA2	P26232	953 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ADSSL1	Q8N142	457 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SCLT1	Q96NL6	688 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PHB	P35232	272 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	IRX4	P78413	519 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LCORL	Q8N3X6	602 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM9	Q9C026	710 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	VCX	Q9H320	206 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GGCX	P38435	758 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AOC3	Q16853	763 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MIS12	Q9H081	205 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GCNT4	Q9P109	453 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ANTXR2	P58335	489 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GPBP1	Q86WP2	473 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NEK9	Q8TD19	979 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BCAM	P50895	628 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ARID5A	Q03989	594 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25	6e-7	■■□□□ 13.2
ACACA-231	ENST00000614428	CEP104	O60308	925 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NR2F2	P24468	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ADAM9	Q13443	819 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KCNK3	O14649	394 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CLGN	O14967	610 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NTRK3	Q16288	839 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CAVIN3	Q969G5	261 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SENP1	Q9P0U3	644 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TTC26	A0AVF1	554 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SPOP	O43791	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DNA2	P51530	1060 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC14	Q49A88	953 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SMC6	Q96SB8	1091 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCT5	P48643	541 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SPATA20	Q8TB22	786 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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