RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 PTH1RQ03431 593 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PIGSQ96S52 555 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TLL1O43897 1013 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 NBNO60934 754 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CXCL10P02778 98 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TRAF1Q13077 416 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 PTK7Q13308 1070 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 IL27Q8NEV9 243 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SENP2Q9HC62 589 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SIP14410 1827 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ERICH2A1L162 156 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CYTH3O43739 400 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SORBS3O60504 671 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 PPFIA4O75335 1185 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 GGPS1O95749 300 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 POLR2MP0CAP2 368 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CHMLP26374 656 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CCND2P30279 289 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 WNT8BQ93098 351 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SPATA33Q96N06 139 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TGFB3P10600 412 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 DEFB103AP81534 67 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SP2Q02086 613 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TROAPQ12815 778 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 WTAPQ15007 396 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 E7EWF7 191 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TFF2Q03403 129 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 TCTN1Q2MV58 587 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 KRT40Q6A162 431 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SPRED2Q7Z698 418 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 NCOA7Q8NI08 942 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.41■■□□□ 1.18
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TRAF4-216ENST00000586813 HIC1Q14526 733 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 NCOR1O75376 2440 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 SGSM2O43147 1006 aa22.4■■□□□ 1.18
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TRAF4-216ENST00000586813 MBTPS1Q14703 1052 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 AAK1Q2M2I8 961 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAF4-216ENST00000586813 EFCAB14O75071 495 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 GJB5O95377 273 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 ANTXR2P58335 489 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SERINC5Q86VE9 423 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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TRAF4-216ENST00000586813 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LPXNO60711 386 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 BMP1P13497 986 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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TRAF4-216ENST00000586813 GNPTABQ3T906 1256 aa22.38■■□□□ 1.17
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TRAF4-216ENST00000586813 H3BRB1 525 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LGR5O75473 907 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 STAM2O75886 525 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LGALS2P05162 132 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 HOXC8P31273 242 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 KCNQ1P51787 676 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RAD9AQ99638 391 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.37■■□□□ 1.17
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