RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.63■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 WNT8BQ93098 351 aa25.63■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 LCHNA4D1U4 455 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 DEFB103AP81534 67 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 PTK7Q13308 1070 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 HIC1Q14526 733 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GRM4Q14833 912 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 IL27Q8NEV9 243 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.62■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 CYTH3O43739 400 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 LPXNO60711 386 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 PPFIA4O75335 1185 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 CYP21A2P08686 494 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GRB10Q13322 594 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TTC22Q5TAA0 569 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 HOMER1Q86YM7 354 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 PIGSQ96S52 555 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 SENP2Q9HC62 589 aa25.61■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GGPS1O95749 300 aa25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 SP2Q02086 613 aa25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 MBTPS1Q14703 1052 aa25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 SPATA33Q96N06 139 aa25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 SORBS3O60504 671 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 KCNQ1P51787 676 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 PTH1RQ03431 593 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TRDNQ13061 729 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 AAK1Q2M2I8 961 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.59■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 GJB5O95377 273 aa25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 POLR2MP0CAP2 368 aa25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TGFB3P10600 412 aa25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 TROAPQ12815 778 aa25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
E2F4-210ENST00000568485 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 CCND2P30279 289 aa25.57■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 TRAF1Q13077 416 aa25.57■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.57■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 EFCAB14O75071 495 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 CHMLP26374 656 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 HOXC8P31273 242 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 SERINC5Q86VE9 423 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 COG5Q9UP83 839 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.56■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 COL9A1P20849 921 aa25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 IKBKEQ14164 716 aa25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 RAD9AQ99638 391 aa25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.55■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 REV3LO60673 3130 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 E7EWF7 191 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 LGR5O75473 907 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 WTAPQ15007 396 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.54■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 ERICH2A1L162 156 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 LINC01553A4QN01 128 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 LGALS2P05162 132 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 ICAM3P32942 547 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 ANTXR2P58335 489 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 ERVK-21P61565 698 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 NCOA7Q8NI08 942 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.53■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 H3BRB1 525 aa25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 SEMA3FQ13275 785 aa25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 EMSYQ7Z589 1322 aa25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 TRANK1O15050 2925 aa25.52■■□□□ 1.68
E2F4-210ENST00000568485 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.51■■□□□ 1.67
E2F4-210ENST00000568485 SGSM2O43147 1006 aa25.51■■□□□ 1.67
E2F4-210ENST00000568485 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.51■■□□□ 1.67
E2F4-210ENST00000568485 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.51■■□□□ 1.67
E2F4-210ENST00000568485 THPOP40225 353 aa25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms