RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565481.5

KIFC3-222, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-222	ENST00000565481	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	REV3L	O60673	3130 aa		13.45	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	NCOR1	O75376	2440 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MEIS2	O14770	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CDC45	O75419	566 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	GGPS1	O95749	300 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RXRA	P19793	462 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PSEN2	P49810	448 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	BFSP2	Q13515	415 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RAB30	Q15771	203 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PTGIS	Q16647	500 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MFSD10	Q14728	455 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	FOSL2	P15408	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	HOXC8	P31273	242 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	KCNB2	Q92953	911 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CUL5	Q93034	780 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	FIBP	O43427	364 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SELP	P16109	830 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	FUT2	Q10981	343 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	NEDD9	Q14511	834 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	GPNMB	Q14956	572 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.41	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	CXCL10	P02778	98 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	LGALS2	P05162	132 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ACTN1	P12814	892 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RCAN1	P53805	252 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PTK7	Q13308	1070 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	HIC1	Q14526	733 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	KRT32	Q14532	448 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	SI	P14410	1827 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
KIFC3-222	ENST00000565481	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KIFC3-222	ENST00000565481	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms