RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CDCA5Q96FF9 252 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FAM210AQ96ND0 272 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 HHIPQ96QV1 700 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CSRNP1Q96S65 589 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.56□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 CEP290O15078 2479 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 B8ZZF3 427 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 LDHCP07864 332 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ATP2B1P20020 1258 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 ATICP31939 592 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TERF1P54274 439 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CYP27A1Q02318 531 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 KCTD2Q14681 263 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 KRT24Q2M2I5 525 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SVIPQ8NHG7 77 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PPM1EQ8WY54 764 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 SOX13Q9UN79 622 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF609O15014 1411 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 PSMD2Q13200 908 aa6.54□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 HSCBQ8IWL3 235 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.54□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 MXD3Q9BW11 206 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PLIN1O60240 522 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 HIP1RO75146 1068 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 NFICP08651 508 aa6.53□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 CFPP27918 469 aa6.53□□□□□ -1.36
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TMOD3-209ENST00000561136 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 IKBKEQ14164 716 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 C16orf46Q6P387 395 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.53□□□□□ -1.36
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