RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TBX3	O15119	743 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MAFG	O15525	162 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	IRF5	Q13568	498 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MEIS1	O00470	390 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	WNT7A	O00755	349 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	FOXN1	O15353	648 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ADCY3	O60266	1144 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ITGB5	P18084	799 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PRPH	P41219	470 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ME1	P48163	572 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CCL14	Q16627	93 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MSH4	O15457	936 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	GAS7	O60861	476 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PPP6R2	O75170	966 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	HMGCR	P04035	888 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TXK	P42681	527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TRIB2	Q92519	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	AR	P10275	920 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TGFB3	P10600	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ICAM3	P32942	547 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2C19	P33261	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TXLNA	P40222	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LBX1	P52954	281 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	NEDD9	Q14511	834 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PTPA	Q15257	358 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	LENG9	Q96B70	501 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ELP1	O95163	1332 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	EDIL3	O43854	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CUTA	O60888	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ELN	P15502	786 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CNGA1	P29973	690 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	GRK4	P32298	578 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TEC	P42680	631 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	RIT2	Q99578	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDB1-223	ENST00000543658	NFASC	O94856	1347 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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