RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 ZBTB43O43298 467 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 TGFB3P10600 412 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MFSD10Q14728 455 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 RTN1Q16799 776 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MEIS2O14770 477 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 CPA1P15085 419 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 PBX2P40425 430 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 BFSP2Q13515 415 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 TIFAQ96CG3 184 aa20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 PPFIA4O75335 1185 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 UBE2SQ16763 222 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 RASIP1Q5U651 963 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MYLIPQ8WY64 445 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 PIK3CDO00329 1044 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 STAM2O75886 525 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 IQCF3P0C7M6 154 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 SP4Q02446 784 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 PBX4Q9BYU1 374 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MSRAQ9UJ68 235 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.27■□□□□ 0.84
FGD2-208ENST00000489356 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 FIBPO43427 364 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 F2P00734 622 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 NEDD9Q14511 834 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 NLRX1Q86UT6 975 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 SESTD1Q86VW0 696 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PITPNM1O00562 1244 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PFKMP08237 780 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ACTN1P12814 892 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ICAM3P32942 547 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ZNF576Q9H609 170 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.26■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 HAS3O00219 553 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 REC8O95072 547 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 HSPA4P34932 840 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 RFC2P35250 354 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 NAPAP54920 295 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 APOBRQ0VD83 1088 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 SEMA3FQ13275 785 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 GRIN2CQ14957 1233 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 Q6ZUG5 572 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 CAGE1Q8TC20 777 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 VWCEQ96DN2 955 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 FOSL2P15408 326 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 RABGGTBP53611 331 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 RAB30Q15771 203 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 METTL7BQ6UX53 244 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.24■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 H3BRB1 525 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 LGALS2P05162 132 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 CDC27P30260 824 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 BRF1Q92994 677 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 SELPP16109 830 aa20.22■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FGD2-208ENST00000489356 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms