RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486514.5

BNC2-209, Transcript of basonuclin 2, humanhuman

TSL 2

Gene BNC2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2-209ENST00000486514 TRDNQ13061 729 aa28.28■■■□□ 2.12
BNC2-209ENST00000486514 HIC1Q14526 733 aa28.28■■■□□ 2.12
BNC2-209ENST00000486514 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.28■■■□□ 2.12
BNC2-209ENST00000486514 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.28■■■□□ 2.12
BNC2-209ENST00000486514 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.28■■■□□ 2.12
BNC2-209ENST00000486514 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
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BNC2-209ENST00000486514 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.27■■■□□ 2.12
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BNC2-209ENST00000486514 LPXNO60711 386 aa28.19■■■□□ 2.1
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BNC2-209ENST00000486514 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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BNC2-209ENST00000486514 MAP4K1Q92918 833 aa28.17■■■□□ 2.1
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BNC2-209ENST00000486514 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.17■■■□□ 2.1
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BNC2-209ENST00000486514 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 LY9Q9HBG7 655 aa28.16■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.16■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 HOXC8P31273 242 aa28.15■■■□□ 2.1
BNC2-209ENST00000486514 THPOP40225 353 aa28.15■■■□□ 2.1
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