RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 BFSP2Q13515 415 aa21.45■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 MFSD10Q14728 455 aa21.45■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 SESTD1Q86VW0 696 aa21.45■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 MAP3K14Q99558 947 aa21.45■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.45■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.45■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 KIF5BP33176 963 aa21.44■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 C7orf31Q8N865 590 aa21.44■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.44■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.43■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 MTA3Q9BTC8 594 aa21.43■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.42■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 ACTN1P12814 892 aa21.42■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 WNT8BQ93098 351 aa21.42■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.42■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.42■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 TGFB3P10600 412 aa21.41■■□□□ 1.02
CLK1-211ENST00000481641 SMARCA1P28370 1054 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.41■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.4■■□□□ 1.02
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CLK1-211ENST00000481641 CALM1P0DP23 149 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLK1-211ENST00000481641 CALM3P0DP25 149 aa21.38■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 ICAM3P32942 547 aa21.38■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 PTK7Q13308 1070 aa21.38■■□□□ 1.01
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CLK1-211ENST00000481641 UBE2SQ16763 222 aa21.37■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.37■■□□□ 1.01
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CLK1-211ENST00000481641 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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CLK1-211ENST00000481641 SLC9A7Q96T83 725 aa21.37■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.37■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 CERS4Q9HA82 394 aa21.37■■□□□ 1.01
CLK1-211ENST00000481641 PTPRSQ13332 1948 aa21.37■■□□□ 1.01
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