RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 SEPT2Q15019 361 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PDXDC1Q6P996 788 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 KCNK18Q7Z418 384 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CUL5Q93034 780 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 C6orf229H3BNL8 230 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TRAF5O00463 557 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TTLL1O95922 423 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SNHG28P0DPA3 235 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 MYBL2P10244 700 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 COASYQ13057 564 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 BAP1Q92560 729 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 RUBCNQ92622 972 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PAFAH1B1P43034 410 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ITIH3Q06033 890 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 EHHADHQ08426 723 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ZNF543Q08ER8 600 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NOX5Q96PH1 765 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PANK4Q9NVE7 773 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PJA2O43164 708 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 EDIL3O43854 480 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 RPS6KA5O75582 802 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GGCXP38435 758 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PSMB7Q99436 277 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GTF2IP78347 998 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 RASSF7Q02833 373 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ECM1Q16610 540 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CRY2Q49AN0 593 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CEP72Q9P209 647 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 POLLQ9UGP5 575 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 BBOX1O75936 387 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CXCR5P32302 372 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GABPAQ06546 454 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 HAS1Q92839 578 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SWAP70Q9UH65 585 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 TSKSQ9UJT2 592 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 F8W031 263 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 PLSCR1O15162 318 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 BUB1O43683 1085 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GNA14O95837 355 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 APBA3O96018 575 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC1A4P43007 532 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 KCNMA1Q12791 1236 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-201ENST00000398741 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.097e-51■□□□□ 8.8
PRAME-201ENST00000398741 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms