RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C GPD2P41911 440 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YGL108CP53139 140 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C GPI1P53306 609 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YMR155WQ03795 547 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SFI1Q12369 946 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPL3P14126 387 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C GLK1P17709 500 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PPH22P23595 377 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RAD14P28519 371 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C AFG1P32317 509 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ATP11P32453 318 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HXT1P32465 570 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C TUL1P36096 758 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C BYE1P36106 594 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RFS1P38234 210 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YGR149WP48236 432 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C IRC15Q02733 499 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SPC19Q03954 165 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RKM5Q12367 367 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CTF3Q12748 733 aa1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C EXO70P19658 623 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CLB3P24870 427 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HXT3P32466 567 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C NFU1P32860 256 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MPE1P35728 441 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C LSM5P40089 93 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SYG1P40528 902 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C VMA13P41807 478 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C VTC2P43585 828 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MNP1P53163 194 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C BTN2P53286 410 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YGR250CP53316 781 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C VTA1Q06263 330 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RHO2P06781 192 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C LPD1P09624 499 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SPS4P09937 338 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C BUB3P26449 341 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C IDH2P28241 369 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YIM1P28625 365 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C THI2P38141 450 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SHO1P40073 367 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ALG8P40351 577 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C DLD2P46681 530 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C VPS74Q06385 345 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ERV2Q12284 196 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RRD2Q12461 358 aa1.74□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C LEU4P06208 619 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SPT15P13393 240 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ATP10P18496 279 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SPR1P32603 445 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MFT1P33441 392 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HCS1P34243 683 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CBP4P37267 147 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FAU1P40099 211 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ELP2P42935 788 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C URB2P47108 1174 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RMD9P53140 646 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data1.73□□□□□ -2.13not detected
HDA3YPR179C SIL1Q08199 421 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YRF1-4O13559 1382 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FAB1P34756 2278 aa1.73□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RML2P32611 393 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YEL045CP32616 141 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C GWT1P47026 490 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C WSC2P53832 503 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ARX1Q03862 593 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CLC1P17891 233 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPC53P25441 422 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YCR051WP25631 222 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FRE2P36033 711 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RSM22P36056 628 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PTH1P38876 190 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C TFG2P41896 400 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SSU1P41930 458 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ARK1P53974 638 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SOV1Q04748 898 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YOR387CQ08910 206 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C TMS1Q12116 473 aa1.72□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C GPH1P06738 902 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PDX1P16451 410 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C REC107P21651 314 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ADK2P26364 225 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NAM9P27929 486 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C GYP6P32806 458 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C REC114P32841 428 aa1.71□□□□□ -2.14
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