RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	YCK1	P23291	538 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SEF1	P34228	1148 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YKL097C	P34245	136 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	RRN3	P36070	627 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MBB1	P39534	108 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MST28	P39552	234 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	GAB1	P41733	394 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YKU80	Q04437	629 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MFB1	Q04922	465 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	BMT2	P38278	337 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	POP1	P41812	875 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.27	□□□□□ -2.21	not detected
VIK1	YPL253C	TRP1	P00912	224 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YBL029W	P38201	376 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MUM2	P38236	366 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YHR131C	P38835	850 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	ERP2	P39704	215 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SSU1	P41930	458 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SSN8	P47821	323 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SLG1	P54867	378 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	IRC25	Q07951	179 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	IES4	Q08561	116 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MUM3	Q08750	479 aa		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	RAV1	P47104	1357 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PRB1	P09232	635 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CHS3	P29465	1165 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	IES5	P40060	125 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	VID30	P53076	958 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PPM1	Q04081	328 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YEH1	Q07804	573 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YPT6	Q99260	215 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YBR137W	P38276	179 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	LAM5	P43560	674 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SOV1	Q04748	898 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	VPS38	Q05919	439 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SSP2	Q08646	371 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	RLM1	Q12224	676 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	ITR1	P30605	584 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	NPL6	P32832	435 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SEO1	P39709	593 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YMR181C	Q03231	154 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	VHS1	Q03785	461 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	FIN1	Q03898	291 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PDS5	Q04264	1277 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YPQ1	Q12010	308 aa		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CYC3	P06182	269 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	POP5	P28005	173 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	KAR9	P32526	644 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YCR041W	P37265	110 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CHK1	P38147	527 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CHS6	P40955	746 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	NGL3	Q03210	505 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	ECM11	Q04110	302 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	TIM18	Q08749	192 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YPS3	Q12303	508 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PRD1	P25375	712 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CBP4	P37267	147 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YIP1	P53039	248 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PCP1	P53259	346 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	NMD4	Q12129	218 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	RRD2	Q12461	358 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	CSE2	P33308	149 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.22	□□□□□ -2.21	not detected
VIK1	YPL253C	LYS14	P40971	790 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YDR239C	Q03780	787 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YPR091C	Q06833	770 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	PLP2	Q12017	286 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	YPR022C	Q12139	1133 aa		1.22	□□□□□ -2.21
VIK1	YPL253C	SLY1	P22213	666 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	FLC2	P39719	783 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	MIG3	P39943	394 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	RFM1	Q12192	310 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	PEP3	P27801	918 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	ARA1	P38115	344 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	MRPS9	P38120	278 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	REG2	P38232	338 aa		1.21	□□□□□ -2.22
VIK1	YPL253C	DFG10	P40526	253 aa		1.21	□□□□□ -2.22

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