RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	ATG7	P38862	630 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	AIM22	P47051	409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	NNF1	P47149	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	DAM1	P53267	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	PRM1	P53835	661 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	YPL014W	Q02606	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	TGL5	Q12043	749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	GTT2	Q12390	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	STE3	P06783	470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	RHB1	P25378	209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	RCK1	P38622	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	RPH1	P39956	796 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	TOM22	P49334	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	EMC4	P53073	190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	YNL260C	P53846	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	ARP10	Q04549	284 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	SOG2	Q08817	791 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	SRN2	Q99176	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	YEL020C	P39994	560 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	MCA1	Q08601	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	GLE1	Q12315	538 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PUT4	YOR348C	RPN13	O13563	156 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MET8	P15807	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	DOM34	P33309	386 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	COG3	P40094	801 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	LAS21	P40367	830 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YPL107W	Q02873	248 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RSC9	Q03124	581 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	FLC1	Q08967	793 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MPM1	P40364	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YJL055W	P47044	245 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SNF12	P53628	566 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GRX5	Q02784	150 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RRN5	Q02983	363 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YLR126C	Q12288	251 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ATP11	P32453	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SOL2	P37262	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	IPT1	P38954	527 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SIT1	P39980	628 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SEG1	Q04279	960 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	KRE28	Q04431	385 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GAL83	Q04739	417 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	COS7	Q07788	383 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YPR011C	Q12251	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GPR1	Q12361	961 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	TRM10	Q12400	293 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RSC6	P25632	483 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	DBP8	P38719	431 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GLG2	P47011	380 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YNL140C	P53910	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	CIK1	Q01649	594 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SPO71	Q03868	1245 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MGR3	Q04472	501 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MRX10	Q05648	414 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PUT2	P07275	575 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ENA1	P13587	1091 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ARA1	P38115	344 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YGR015C	P53208	328 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ENA2	Q01896	1091 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	VHS1	Q03785	461 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ORM2	Q06144	216 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PER33	Q12144	273 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	ENA5	Q12691	1091 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YJR030C	P47101	745 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	TWF1	P53250	332 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	COG5	P53951	403 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	CDC4	P07834	779 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	NUF2	P33895	451 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YLF2	P38746	405 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GPI8	P49018	411 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PRM8	P53174	237 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	HEM14	P40012	539 aa		13.65	□□□□□ -0.22

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