RNA–Protein interactions for RNA: YOR229W

WTM2, Transcript of Transcriptional modulator, yeast

Gene WTM2, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WTM2	YOR229W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	VMA16	P23968	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	KAR4	P25583	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	PEP3	P27801	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MOH1	P38191	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	FIG1	P38224	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	PZF1	P39933	429 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YER158C	P40095	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	HPM1	P40481	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	FMC1	P40491	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ELP2	P42935	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YJR056C	P47115	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	IMA1	P53051	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ACS1	Q01574	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YMD8	Q03697	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ROY1	Q04847	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ATG23	Q06671	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
WTM2	YOR229W	COX17	Q12287	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	GPR1	Q12361	961 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	KIN28	P06242	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	CBF1	P17106	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	DGR2	P32330	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YPT53	P36019	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	FES1	P38260	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	NUP60	P39705	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MET28	P40573	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YFR018C	P43599	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RTT101	P47050	842 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RCN2	Q12044	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	UPC2	Q12151	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ARP6	Q12509	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	SEY1	Q99287	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RAV1	P47104	1357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	SNF6	P18888	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RHB1	P25378	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YCR101C	P25607	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	PRE4	P30657	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TCA17	P32613	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	VAM7	P32912	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MRX3	P38172	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TDP1	P38319	544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YHR045W	P38775	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RPH1	P39956	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RGI2	P40188	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	CHS6	P40955	746 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	BST1	P43571	1029 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TAF6	P53040	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	MND1	P53102	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YGL138C	P53122	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TIM21	P53220	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	TWF1	P53250	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YGR127W	P53275	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
WTM2	YOR229W	REG1	Q00816	1014 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	CTF19	Q02732	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	URH1	Q04179	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	RCO1	Q04779	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	DXO1	Q06349	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	AAD4	Q07747	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	AFI1	Q99222	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WTM2	YOR229W	SPT3	P06844	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	RAD14	P28519	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	SPO23	P33757	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WTM2	YOR229W	YOX1	P34161	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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