RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	NAM9	P27929	486 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	VPH2	P32341	215 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	SEC66	P33754	206 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	ETR1	P38071	380 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	TRM5	P38793	499 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	GGC1	P38988	300 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	MET30	P39014	640 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	HOC1	P47124	396 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	TIS11	P47977	285 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	YGR016W	P53209	190 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	HST2	P53686	357 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	NHP10	Q03435	203 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	AKR2	Q12013	749 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	TAF3	Q12297	353 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	SPE4	Q12455	300 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDC1	YML031W	STE3	P06783	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	DGR2	P32330	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TSC10	P38342	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MUP3	P38734	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GOT1	Q03554	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SPO20	Q04359	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CRN1	Q06440	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YET3	Q07451	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	UBX3	Q12229	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SRN2	Q99176	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	KAR1	P11927	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MEF1	P25039	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RAD14	P28519	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	KKQ8	P36004	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MOH1	P38191	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	AIM20	P40451	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	IAH1	P41734	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ATF2	P53296	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BUD32	P53323	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YNL260C	P53846	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ORM2	Q06144	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GET4	Q12125	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HUA2	Q12134	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YCR102C	P25608	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PTM1	P32857	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SDH3	P33421	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	EMP65	P40085	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GID8	P40208	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MAM33	P40513	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MPH1	P40562	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PHB1	P40961	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	STB2	P46679	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ROM1	P53046	1155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	LCL3	P53153	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YNL092W	P53934	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TAF12	Q03761	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BDS1	Q08347	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TPO4	Q12256	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PMT2	P31382	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NPL6	P32832	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RRN3	P36070	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RPS27B	P38711	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YDR089W	P38966	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	VRG4	P40107	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YIL152W	P40455	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	APQ12	P40532	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	AZF1	P41696	914 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MRM2	P53123	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SLT2	Q00772	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NUP53	Q03790	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BCP1	Q06338	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ATG17	Q06410	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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