RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	ATG27	P46989	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ALT2	P52892	507 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YGL082W	P53155	381 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SPC19	Q03954	165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TAP42	Q04372	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	GLO2	Q05584	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SCM3	Q12334	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	COR1	P07256	457 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	GLN3	P18494	730 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PMT1	P33775	817 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	BZZ1	P38822	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YND1	P40009	630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	HXT14	P42833	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SAD1	P43589	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	GUF1	P46943	645 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YJR154W	P47181	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	CUL3	P53202	744 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SAM50	P53969	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	THI20	Q08224	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PMS1	P14242	873 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ERG3	P32353	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	NPL6	P32832	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	VPS17	P32913	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SEC66	P33754	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	BNA4	P38169	460 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PFF1	P38244	976 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YTA12	P40341	825 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ALE1	Q08548	619 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SFI1	Q12369	946 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SEC62	P21825	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	ECM15	P35195	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	CSM2	P40465	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
MTD1	YKR080W	RBA50	Q04418	439 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	GRS2	Q06817	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YEH2	Q07950	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	APE1	P14904	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	MSN2	P33748	704 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	DUG2	P38149	878 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	MBB1	P39534	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YJL068C	P40363	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	VTC2	P43585	828 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	ERO1	Q03103	563 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	FLO11	P08640	1367 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SUC2	P00724	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	CDC23	P16522	626 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	NFU1	P32860	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SAS3	P34218	831 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	RIM2	P38127	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
MTD1	YKR080W	RMT2	Q03305	412 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	IVY1	Q04934	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	CLB3	P24870	427 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YCR007C	P25354	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	UTR4	P32626	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	BYE1	P36106	594 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SHC1	P39000	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YIL089W	P40500	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SLG1	P54867	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SLD5	Q03406	294 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	PHO92	Q06390	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	PPZ1	P26570	692 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	VPS52	P39904	641 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	IKS1	P47042	667 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	YGL108C	P53139	140 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	NRT1	Q08485	598 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MTD1	YKR080W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms