RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
RPC10YHR143W-A BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RIM20Q12033 661 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YER078W-AQ3E7A2 54 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SPS4P09937 338 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A HEM15P16622 393 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GPI10P30777 616 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RRT5P43607 289 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A IRC6P43615 237 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A AVT4P50944 713 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A PNG1Q02890 363 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ODC1Q03028 310 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A TAP42Q04372 366 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ESA1Q08649 445 aa2.26□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ATP10P18496 279 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YCR100CP25606 316 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A AFG1P32317 509 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.25□□□□□ -2.05not detected
RPC10YHR143W-A PMT1P33775 817 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YBL059WP34224 193 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NAT2P37293 288 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A OTU2P38747 307 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YFL067WP43537 175 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SSN8P47821 323 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YGR149WP48236 432 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SHE10P53075 577 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ART5P53244 586 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A BTN2P53286 410 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MRP51Q02950 344 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ERV2Q12284 196 aa2.25□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GPH1P06738 902 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A CHS1P08004 1131 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YCR041WP37265 110 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.24□□□□□ -2.05not detected
RPC10YHR143W-A ESL1P40456 1118 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YIL067CP40514 678 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A TFG2P41896 400 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YGR210CP42942 411 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A VTC2P43585 828 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A DSL1P53847 754 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A PBA1Q05778 276 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A TSR2Q06672 205 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MUM3Q08750 479 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YOR387CQ08910 206 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YPL199CQ08954 240 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GRX6Q12438 231 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RRD2Q12461 358 aa2.24□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YLR278CQ05854 1341 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A CKA1P15790 372 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ROX1P25042 368 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SPS22P25380 463 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NIP100P33420 868 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A THI2P38141 450 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MIX23P38162 196 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NDT80P38830 627 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SMF1P38925 575 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A TRS85P46944 698 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YIP1P53039 248 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A VTA1Q06263 330 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YLR108CQ12259 485 aa2.23□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A CLC1P17891 233 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A CPR4P25334 318 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A LDB16P25587 256 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NAM9P27929 486 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ECM25P32525 599 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SWE1P32944 819 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SDH3P33421 198 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A REE1P40893 198 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ECM27P47144 725 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MNP1P53163 194 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MRPL19P53875 158 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RTP1Q12751 981 aa2.22□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MET17P06106 444 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RED1P14291 827 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YIM1P28625 365 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A APE2P32454 952 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
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